Różnica między kolonią a hybrydyzacją płytki nazębnej - Różnica Pomiędzy

Różnica między kolonią a hybrydyzacją płytki nazębnej

The główna różnica między hybrydyzacją kolonii i płytki nazębnej jest to, że hybrydyzacja kolonii jest metodą stosowaną w selekcji kolonii bakteryjnych z pożądanymi genami, podczas gdy hybrydyzacja łysinek jest metodą selekcji fagów z pożądanymi genami. Co więcej, hybrydyzacja kolonii może być wykorzystana w badaniach przesiewowych bibliotek opartych na plazmidach lub kosmidach, podczas gdy hybrydyzacja łysinek może być wykorzystana w badaniach przesiewowych bibliotek fagowych.

Hybrydyzacja kolonii i łysinek to dwie techniki stosowane w badaniach przesiewowych bibliotek genomowych lub cDNA. Są również nazywane wyciąg z kolonii i podnośnik tablicowy odpowiednio.

Kluczowe obszary objęte

1. Co to jest hybrydyzacja kolonii
     – Definicja, typ bibliotek, metody przesiewowe
2. Co to jest hybrydyzacja płytki nazębnej
     – Definicja, typ bibliotek, metody przesiewowe
3. Jakie są podobieństwa między kolonią a hybrydyzacją płytki nazębnej
     – Zarys wspólnych cech
4. Czym różni się hybrydyzacja kolonii od płytki nazębnej
     – Porównanie kluczowych różnic

Kluczowe terminy

Kolonia, hybrydyzacja kolonii, przesiewanie biblioteki, tablica, hybrydyzacja płytki nazębnej


Co to jest hybrydyzacja kolonii

Hybrydyzacja kolonii jest metodą przesiewową stosowaną w selekcji kolonii bakteryjnych z pożądaną sekwencją DNA. Jest także nazywany hybrydyzacja plam kolonii, podnoszenie kolonii lub poszycie repliki. Umożliwia przesiewanie kolonii wysianych z dużą gęstością. Pierwotna procedura hybrydyzacji kolonii została opracowana przez Grunsteina i Hognessa. Po pierwsze, kolonie bakteryjne mogą być transformowane na błonę, a kolonie bakteryjne ulegają lizie, odsłaniając kwasy nukleinowe. Następnie odsłonięte kwasy nukleinowe są utrwalane na błonie przez denaturację i hybrydyzowane z sondami radioaktywnymi.


Rysunek 1: Metoda hybrydyzacji kolonii

Kolonia to skupisko bakterii powstałe z pojedynczej komórki bakteryjnej poprzez rozmnażanie bezpłciowe. W związku z tym wszystkie komórki bakteryjne w określonej kolonii posiadają ten sam skład genetyczny, jak również transformowany materiał genetyczny. Ogólnie, bakterie transformuje się za pomocą wektorów plazmidowych lub kosmidowych.

Co to jest hybrydyzacja płytek?

Hybrydyzacja łysinkowa jest metodą przesiewową dla rekombinowanych fagów. Jest to modyfikacja hybrydyzacji kolonii dokonana przez Bentona i Devisa w 1977 r. Metoda ta jest również nazywana podnośnik tablica. Procedura hybrydyzacji łysinek jest podobna do procedury hybrydyzacji kolonii i łysinki są podnoszone przez kontaktowanie ich z błoną nitrocelulozową. Kwasy nukleinowe są następnie eksponowane i mocowane na membranie, hybrydyzując z pożądanymi sondami.


Figura 2: Płytki na płytce agarowej

Płytka nazębna jest wyraźną strefą na płytce agarowej wytwarzanej przez określonego bakteriofaga przez lizę komórek bakteryjnych na tym obszarze. Ze względu na mniejszą ilość DNA przenoszonego na błonę nitrocelulozową, hybrydyzacja płytkowa wytwarza mniej sygnałów tła.

Podobieństwa między kolonią a hybrydyzacją płytki nazębnej

  • Hybrydyzacja kolonii i łysinek to dwie techniki stosowane w badaniach przesiewowych bibliotek genomowych lub cDNA.
  • Główną zasadą w obu technikach jest hybrydyzacja kwasów nukleinowych.
  • Oba są metodami hybrydyzacji filtrów, które umożliwiają pierwotne badanie przesiewowe bibliotek przez replikację in Situ na membranie nitrocelulozowej.
  • Umożliwiają przesiewanie o wysokiej gęstości.
  • Jednoniciową cząsteczkę DNA stosuje się jako sondę, która może hybrydyzować ze swoją komplementarną sekwencją w celu identyfikacji specyficznych sekwencji.
  • Obie techniki hybrydyzacji są szybkie i mogą obsłużyć bardzo dużą liczbę klonów.
  • Są one używane do identyfikacji niekompletnych sekwencji genów, których nie można wyrazić.

Różnica między kolonią a hybrydyzacją płytki nazębnej

Definicja

Hybrydyzacja kolonii odnosi się do metody selekcji kolonii bakteryjnych z pożądanymi genami, podczas gdy hybrydyzacja łysinek odnosi się do metody przesiewowej stosowanej do identyfikacji rekombinowanych fagów.

Opracowany przez

Hybrydyzacja kolonii została po raz pierwszy opracowana przez Grunsteina i Hognessa, podczas gdy hybrydyzacja płytki została po raz pierwszy opracowana przez Bentona i Devisa w 1977 roku.

Typy bibliotek

Hybrydyzacja kolonii obejmuje identyfikację bibliotek opartych na plazmidach lub kosmidach, podczas gdy hybrydyzacja łysinek obejmuje identyfikację bibliotek fagowych.

Liczba wind

Kolonie można podnieść na jeden raz, a płytki można podnieść kilka razy.

Sygnały tła

W hybrydyzacji kolonii pojawia się więcej sygnałów tła, podczas gdy sygnały tła są mniej w hybrydyzacji płytki.

Wniosek

Hybrydyzacja kolonii jest metodą przesiewową kolonii bakteryjnych w bibliotekach wytwarzanych za pomocą wektorów plazmidowych lub kosmidowych. Z drugiej strony hybrydyzacja łysinek jest metodą przesiewową bakteriofagów w bibliotekach fagowych. Główną różnicą między hybrydyzacją kolonii i płytki nazębnej jest typ bibliotek badanych w każdej metodzie.

Odniesienie:

1. Kaksonen, Anna. „Molekularne metody analizy społeczności drobnoustrojów”. Leaching - BioMineWiki, 20 kwietnia 2006 r.,