Różnica między lentiwirusem a retrowirusem - Różnica Pomiędzy

Różnica między lentiwirusem a retrowirusem

Główna różnica - Lentiwirus a retrowirus

Lentiwirus i retrowirus to dwa rodzaje wirusów, które infekują żywe komórki do zakończenia ich cyklu życia. Lentiwirus jest podtypem retrowirusów. The główna różnica między lentiwirusem a retrowirusem jest to lentiwirus może infekować zarówno aktywnie dzielące się, jak i niedzielące się komórki, podczas gdy retrowirusy mogą infekować tylko aktywne komórki mitotycznie. Zatem lentiwirus może infekować szeroki zakres stadiów komórkowych niż retrowirusy. Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus mogą być stosowane jako nośniki przenoszące cząsteczki obcego DNA do innej komórki. Mechanizm przenoszenia DNA za pośrednictwem wirusów jest znany jako transdukcja. Zarówno lentiwirusy, jak i retrowirusy są wykorzystywane do korygowania wadliwych genów odpowiedzialnych za rozwój choroby.

Kluczowe obszary objęte

1. Co to jest Lentivirus
- Definicja, właściwości, typy
2. Co to jest retrowirus
- Definicja, właściwości, typy
3. Jakie są podobieństwa między lentiwirusem a retrowirusem
- Zarys wspólnych cech
4. Jaka jest różnica między lentiwirusem a retrowirusem
- Porównanie kluczowych różnic

Pojęcia kluczowe: HIV, Lentiwirus, rekombinowana technologia DNA, retrowirus


Czym jest Lentivirus

Lentiwirus to rodzaj retrowirusa, który składa się z długich okresów inkubacji i powoduje przewlekłe, postępujące i zazwyczaj śmiertelne choroby u zwierząt. Lentiwirusy można podzielić na pięć serotypów w zależności od rodzaju gospodarza kręgowca, który zakażają; bydło, konie, koty, owce / kozy i naczelne. Przykładami lentiwirusów są wirusy ludzkiego niedoboru odporności (HIV) i 2, małpy (SIV) i koci (FLV). Lentiwirusy stosuje się do wprowadzania dużych segmentów DNA do linii komórkowej (dzielenia), komórek pierwotnych (dzielących się i nie dzielących), komórek neuronalnych, komórek macierzystych i komórek krwiotwórczych. Większość wektorów lentiwirusowych opiera się na HIV. Struktura HIV jest pokazana w rysunek 1.


Rysunek 1: HIV

Wielkość genomu HIV wynosi 9,7 kb. Trzy główne geny strukturalne obecne w genomie to geny knebel (antygen specyficzny dla grupy), pol (polimeraza) i env (koperta). Pozostałe geny regulacyjne to robić frywolitki (Transaktywator HIV) i obrót silnika (regulator ekspresji białka wirionu). Ponadto w genomie HIV obecne są cztery rodzaje genów pomocniczych: vif (zakaźność wirusowa), vpr (wirusowe białko R), vpu (białko wirusa U) i nef (czynnik negatywny). W replikacji, integracji i pakowaniu lentiwirusów pośredniczą elementy genomu lentiwirusowego działające w układzie cis.

Czym jest Retrovirus

Retrowirus jest dowolnym rodzajem wirusów RNA, które wstawiają kopię DNA do genomu gospodarza w celu replikacji. Retrowirusy charakteryzują się zdolnością do odwrotnej transkrypcji genomu RNA na kopię cDNA, która może być zintegrowana z genomem gospodarza. Składają się z dwóch kopii pozytywnych cząsteczek ssRNA w genomie. Retrowirusy można podzielić na trzy podrodziny w oparciu o różne rodzaje genów pomocniczych i regulacyjnych obecnych w genomie. Są to onkowirusy, lentiwirusy i spumawirusy. Onkowirusy dzieli się na trzy kategorie w oparciu o morfologię; Typ B, typ C i typ D. Różne podrodziny retrowirusów z przykładami opisano w Tabela 1.

Retrowirusowe podrodziny i przykłady

Podrodzina Retrowirusa

Przykłady

Onkowirus typu B.

Mysi wirus nowotworu sutka (MMTV)

Onkowirus typu C

Wirus ludzkiej białaczki T-komórkowej (HTLV), białaczka ptasia i wirusy mięsaka (ALSV) i wirus chłoniaka Salmon

Onkowirus typu D

Wirus małp Mason-Pfizer (MPMV)

Lentiwirusy

Ludzkie wirusy upośledzenia odporności (HIV), wirus owadów maedi-visna (MVV) i wirus zakaźnej niedokrwistości koni (EIAV)

Spumawirusy

Simian spienione wirusy (SFV)

Retrowirusy składają się z enzymu odwrotnej transkryptazy do odwrotnej transkrypcji genomu RNA. Białka strukturalne i enzymatyczne, takie jak kapsyd (CA), nukleokapsyd (NC), integraza (IN) i proteaza (PR) znajdują się wewnątrz przedziału retrowirusowego.


Figura 2: Mechanizm zakażenia HIV

Wewnętrzny rdzeń retrowirusa jest otoczony przez zewnętrzną warstwę białkową, składającą się z białka macierzy (MA). Otoczka retrowirusa pochodzi z błony komórki gospodarza. Retrowirusy infekują dzielące się linie komórkowe i komórki pierwotne, komórki macierzyste i komórki krwiotwórcze.

Podobieństwa między lentiwirusem a retrowirusem

  • Lentiwirus i retrowirus to dwa typy wirusów, które infekują żywe komórki.
  • Kapsyd zarówno lentiwirusa, jak i retrowirusa ma kształt dwudziestościenny i oba są wirusami otoczkowymi.
  • Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus składają się z dwóch kopii genomu ssRNA o sensie dodatnim.
  • Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus składają się z odwrotnej transkryptazy (RT).
  • Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus są zdolne do odwrotnej transkrypcji swojego genomu RNA na kopię cDNA.
  • Genom lentiwirusa i retrowirusa jest kodowany dla polimeraz.
  • Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus mogą być stosowane jako nośniki przenoszące cząsteczki obcego DNA do innej komórki.
  • Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus są wykorzystywane w technologii rekombinacji DNA do wprowadzenia stosunkowo dużych segmentów obcego DNA do komórek zwierzęcych.
  • Zarówno lentiwirusy, jak i retrowirusy są wykorzystywane w terapii genowej do korygowania wadliwych genów odpowiedzialnych za rozwój choroby.
  • Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus wykorzystują różne izoformy knebel, pol, i env geny do pakowania.
  • Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus mogą infekować dzielące się komórki, komórki macierzyste i komórki krwiotwórcze.
  • Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus mają szeroki zakres gospodarzy.
  • Wielkość wstawki zarówno lentiwirusa, jak i retrowirusa wynosi około 8,0 kb.
  • Zarówno lentiwirus, jak i DNA retrowirusa są zintegrowane z genomem.
  • Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus można zintegrować do 10 kopii.
  • Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus nie mają bardzo wysokiego poziomu ekspresji białka.
  • Zalecanym poziomem bezpieczeństwa biologicznego zarówno lentiwirusa, jak i retrowirusa jest BSL-2.

Różnica między lentiwirusem a retrowirusem

Definicja

Lentivirus: Lentiwirus jest rodzajem retrowirusa, składającym się z długich okresów inkubacji i powodujących przewlekłe, postępujące i zwykle śmiertelne choroby u zwierząt.

Retrowirus: Retrowirus jest dowolnym rodzajem wirusa RNA, który wprowadza kopię DNA do genomu gospodarza w celu replikacji.

Rodzaje infekujących komórek

Lentivirus: Lentiwirus może zarażać zarówno aktywnie dzielące się, jak i niedzielące się komórki.

Retrowirus: Retrowirusy mogą jedynie infekować typy komórek aktywnych mitotycznie.

Typy

Lentivirus: Lentiwirus to rodzaj retrowirusów.

Retrowirus: Trzy rodzaje retrowirusów to onkowirusy, lentiwirusy i spumawirusy.

Zasięg

Lentivirus: Lentiwirus może infekować szeroki zakres stadiów komórkowych.

Retrowirus: Retrowirus może infekować wąski zakres stadiów komórkowych.

Rozmiar genomu

Lentivirus: Wielkość genomu lentiwirusowego typu dzikiego wynosi 9,7 kb.

Retrowirus: Wielkość genomu retrowirusowego typu dzikiego wynosi 8,3 kb.

Geny akcesoriów

Lentivirus: Lentiwirusy składają się z dodatkowych genów w genomie.

Retrowirus: Niektóre retrowirusy, takie jak onkowirusy, nie mają dodatkowych genów.

Wniosek

Lentiwirus i retrowirus to dwa typy wirusów, które infekują żywe komórki. Lentiwirus to rodzaj retrowirusów. Zarówno lentiwirus, jak i retrowirus są wykorzystywane w technologii rekombinacji DNA do wprowadzenia stosunkowo dużych segmentów obcego DNA do komórek zwierzęcych. Lentiwirus może infekować zarówno dzielące się, jak i niedzielące się komórki, ale retrowirusy mogą infekować tylko dzielące się komórki. Jest to główna różnica między lentiwirusem a retrowirusem.

Odniesienie:

1. O’Keefe, Eric P. „Dostarczanie kwasu nukleinowego: wektory lentiwirusowe i retrowirusowe”.Materiały i metody, 15 czerwca 2015 r.,